История создания монографического фонда палеонтологических коллекций в Музее Землеведения МГУ начинается с открытия монографического отдела, позднее преобразованного в монографический кабинет, в который с 1966 года стали поступать на хранение коллекции оригиналов к опубликованным монографиям и статьям. В 1995 г. Монографический кабинет был ликвидирован и коллекции перешли на хранение в отдел фондов Музея.
Авторские коллекции представлены голотипами и оригиналами, описанными и изображенными в опубликованных работах, эталонными коллекциями к стратотипическим разрезам, а также дублетными материалами. Оригиналы представлены моллюсками, брахиоподами, мшанками, членистоногими, стрекающими и хордовыми. Среди оригиналов имеются уникальные не только по своей сохранности, но и систематической принадлежности.
Коллекционный материал почти полностью охватывает временной интервал фанерозоя. Он собран на территории европейской части России, Казахстана, Туркмении, Азербайджана, а также Монголии. Значительную часть фонда составляют материалы коллекций, собранные на Северном Кавказе, в Крыму и Центральном Казахстане.
Музей принимает на хранение коллекции от специалистов геологического факультета МГУ, других организаций Москвы, а также от зарубежных ученых. К настоящему времени в МЗ находится на хранении более 100 монографических палеонтологических коллекций, включающих свыше 5,5 тыс. образцов. В базе данных хранятся оцифрованные публикации ко всем коллекциям.
Выпущены 4 тематических каталога монографических коллекций, в которых сосредоточена информация о коллекциях по всем группам ископаемых, хранящихся в монографическом фонде Музея: Аммониты, Двустворчатые моллюски, Брахиоподы и Комплексный каталог, включающий коллекции по всем остальным группам ископаемых (Белемниты, гастроподы, мшанки, кораллы, ихнофосилии, усоногие раки, наутилоидеи, бесчелюстные и древние рыбы).